imp_region im_param not accepting all listed parameters

Question

Hello everyone,

I am trying to modify a list of parameters for the ToRORd_dynCl ionic model using imp_region[0].im_param defined in the parameter file. For some reason it is only accepting a certain length of the string of parameters mentioned. So for example in the im_param I define a long string for ionic model parameters but only the first say 100 characters of the string are being accepted. The characters in string after that throw an error saying "Unrecognized keyword". 

This is what I am defining in the parameter file:

num_imp_regions = 1

imp_region[0].im = ToRORd_dynCl

imp_region[0].num_IDs  = 65

imp_region[0].im_param = "flags=EPI,GNa=1.5788e+01,GNaL_b=1.8332e-01,Gto_b=8.1327e-02,PCa_b=2.5652e-04,GKr_b=6.2616e-02,GKs_b=1.1041e-03,GK1_b=1.4432e+00,Gncx_b=7.5696e-03,Pnak_b=5.0441e+01,GKb_b=6.6005e-02,GClCa=5.5524e-01,cmdnmax_b=1.8078e-01,Jup_b=1.1585e+00,Jrel_b=1.8615e+00"

This is the error I get when I run the simulation:

*** Unrecognized keyword 85e+00

*** Error reading parameters

The 85e+00 is a part of the value defined for Jup_b. 

I have tried assigning parameter modifications in multiple lines but in that case only the parameters defined in the last line are being modified. Does anyone know the reason for this error? Is it a bug? I am using CARPentry.

I would appreciate it if you could give me some advice on how to solve the problem!

Thanks

Comments

"ميسِّر" هي منصة متكاملة تتيح للأطباء الأردنيين الترويج لخبرتهم وخدماتهم، بالإضافة إلى تزويدهم بنظام شامل لإدارة عيادتهم، وذلك مقابل أسعار تنافسية تمكّنهم من اللحاق بركب التقدم والاستفادة من التكنولوجيا الحديثة.
تقدم منصة "ميسر" للخدمات الطبية باقة من الخدمات الحصرية، فهي المنصة الأولى التي تتيح للطبيب الترويج لخدمته وزيادة شعبيته، بالإضافة إلى تزويده بنظام أمريكي متقدم لإدارة عيادته وتنظيم مهامه.
منصة "ميسِّر" للخدمات الطبية تعدك بتقديم نظام متكامل لإدارة عيادتك، إذ يقع مركزنا الرئيسي في "كاليفورنيا، الولايات المتحدة" ونحرص على تقديم تكنولوجيا أمريكية حديثة للطبيب الأردني.
نحن في منصة "ميسِّر" للخدمات الطبية نحرص على تزويدك بنظام لإدارة العيادات والترويج لخبرتك عبر منصة أخرى تستهدف الوصول لمرضاك، ومن ثم زيادة شعبيتك وعائدك المادي.
https://mmsjo.net/

---

تألقي بأناقة فريدة مع عباياتنا الفاخرة من لاجيت ، حيث يجتمع الأناقة بالفخامة لتمنحك إطلالة لا تُضاهى. تصاميمنا تتميز بالدقة في التفاصيل واختيار الأقمشة عالية الجودة، مما يعكس رونق الأنوثة بأسلوب محافظ وراقٍ. تتوفر لدينا مجموعة واسعة من الألوان والأنماط التي تناسب جميع المناسبات، سواء كنتِ تبحثين عن قطعة للإطلالات اليومية أو للمناسبات الخاصة. كل قطعة تحمل بصمة فنية فريدة، مما يجعلكِ تتألقين بأسلوب لا يُضاهى. اكتشفي مجموعتنا الفاخرة واستمتعي بتجربة تسوق استثنائية تليق بجمالك ورقي ذوقك
https://lagatesa.com/ar

Answer 1

The parameter file seams to have a line limit for 255 characters.

As a quick fix you might try to rewrite your parameters to fit within that limit (removing +e00 or replacing -e02 with -e2 etc.). In your case it would result to a line:

imp_region[0].im_param="flags=EPI,GNa=15.788,GNaL_b=1.8332e-1,Gto_b=8.1327e-2,PCa_b=2.5652e-4,GKr_b=6.2616e-2,GKs_b=1.1041e-3,GK1_b=1.4432,Gncx_b=7.5696e-3,Pnak_b=5.0441e+1,GKb_b=6.6005e-2,GClCa=5.5524e-1,cmdnmax_b=1.8078e-1,Jup_b=1.1585,Jrel_b=1.8615"

For a more robust solution you would need to change the code of the simulator directly.